El Misionero General de la AEMINPU, el excelentísimo Hermano EZEQUIEL JONÁS ATAUCUSI MOLINA (Israel) es el Representante mayor en el Orden Espiritual y simboliza a la institución.
El Misionero General tiene la facultad de efectuar el cambio total ó parcial de los dirigentes de los órganos que conforman la estructura orgánica de la “AEMINPU” a nivel nacional e internacional cuando las circunstancias así lo requieran (Artículo Trigésimo Cuarto).